农村合作医疗的报销比例根据就诊机构的不同而有所差异，具体如下：
- 门诊报销比例 ：
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村卫生室及村中心卫生室就诊：60%
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乡卫生院就诊：40%
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二级医院就诊：30%
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三级医院就诊：20%
- 住院报销比例 ：
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乡卫生院住院：60%
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二级医院住院：40%
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三级医院住院：30%
- 大病补偿 ：
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对于参加新农合的住院病人，若一次性或全年累计的医疗费用超过5000元，将分段进行赔偿：
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5001元至1万元的部分可补偿65%
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10001元至1.8万元的部分可补偿70%
此外，还有一些额外的报销规定：
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每次就诊的检查和手术费用控制在50元以内，处方药费用控制在100元以内，附有发票的处方限定在1元以内。
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镇级合作医疗门诊年补偿限额为5000元。
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中药发票附上处方每贴限额1元。
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60周岁以上老人在镇卫生院住院，治疗费和护理费每天补偿10元，限额200元。
建议：
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在选择就诊医院时，可以考虑医院等级和报销比例，以最大化报销金额。
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对于大病治疗，了解大病补偿政策，确保能够获得更高的补偿。
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注意各项费用限额，避免超出报销范围。
