当公司开始为员工缴纳社保（即职工社会保险）时，员工需要 停掉农村医疗保险（新农合） 。这是因为社保和新农合（新型农村合作医疗）是两种不同的医疗保险制度，它们不能同时享受。具体来说：
- 对于在外地打工的农村居民 ：
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交社保可以不将新农合停掉。
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但新农合与社保同时缴费，在报销医疗费用的问题上却不能同时报销。
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因此，单位交了社保就不需要再交新农合的费用了。
- 对于在当地上班的农村居民 ：
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社保和新农合两者只能选其一。
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因此，单位帮交社保，就需要将新农合停掉。
- 法律依据 ：
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《社会保险法》第二十六条规定，职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
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这意味着参保人只能享受一种医疗保险待遇，不能同时参加两种医疗保险。
综上所述，当公司开始为员工缴纳社保时，员工需要根据自身情况选择停掉新农合，以确保能够享受职工医疗保险的待遇。如果员工同时缴纳了新农合和职工医疗保险，可能会导致无法同时享受两种待遇，因此建议选择其中一种进行缴纳。
