交了灵活就业社保后，通常不需要再交农村合作医疗 。灵活就业社保已经包括了基本医疗保险，与农村合作医疗的功能有所重叠。重复缴纳不仅会增加经济负担，而且依据《中华人民共和国社会保险法》第二十三条的规定，灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费，这意味着你已经有了医疗保障，无需再额外缴纳农村合作医疗。